L’espace dans lequel s’élève la petite église de San Filippo était habitée depuis l’antiquité.
Les premiers documents attestant de la présence des templiers à San Filippo de’Plano remonte à 1187. La chapelle romane semble antérieure à l’arrivée des chevaliers sur le belvédère.
La commanderie était située à la croisée de deux routes commerciales : la Salaria, prenant la direction du nord et la Flaminia, voie vers le sud. Le territoire à la terre fertile grâce à l’irrigation de la rivière Musone était ainsi productif et stratégique.
Entre 1264 et 1284, sous l’évêque Benvenuto, la région de San Filipo comptait 16 moulins dont il reste aujourd’hui des toponymes ( » Mulino San Filippo », « Mulino San Polo »).
Après la dissolution de l’ordre du Temple, le domaine est remis à l’ordre de l’Hôpital mais le destin des templiers de San Filippo reste encore un mystère.